用Graphpad Prism 8.0绘制Cleveland点图

用 GraphPad Prism 8.0 绘制 Cleveland 点图：无需编程的科研可视化实践

在撰写论文或准备学术报告时，你是否曾为如何清晰呈现多组实验数据而苦恼？柱状图容易误导读者对离散值的理解，箱线图又可能掩盖个体观测点的信息。有没有一种图表，既能准确反映每个数据点的位置，又能直观展示组间趋势差异？

答案是肯定的——Cleveland 点图（Cleveland Dot Plot）正是为此类需求而生。它以简洁的点加垂线形式展现数值分布，避免了传统柱状图中“面积效应”带来的视觉偏差，特别适合用于比较多个类别下的测量结果。

对于大多数科研工作者而言，R 或 Python 虽然可以实现这类图形绘制，但学习成本高、调试耗时长。而GraphPad Prism 8.0提供了一种完全可视化的替代方案：无需编写任何代码，只需几次点击和设置，就能生成可直接投稿的高质量 Cleveland 点图。

下面我们就从零开始，一步步构建这样一张专业级图表，并深入解析每一步背后的逻辑与设计考量。

准备工作：为什么选择 GraphPad Prism 8.0？

GraphPad Prism 自推出以来，一直是生命科学领域研究人员最信赖的数据分析工具之一。其最新版本Prism 8.0在图形渲染能力、界面响应速度和导出灵活性方面均有显著提升：

• 支持最高1200 dpi的 TIFF 图像导出；
• 单图最大宽度扩展至25 英寸，轻松满足海报制作与高分辨率出版要求；
• 新增多类图形模板与格式化选项，支持更精细的视觉控制；
• 可保存自定义图形模板，便于团队统一风格标准。

更重要的是，Prism 的操作全程基于图形界面，所有修改都能实时预览，极大降低了非编程用户的使用门槛。即使是第一次接触该软件的研究者，也能在半小时内掌握基本绘图流程。

第一步：创建合适的数据表结构

打开 GraphPad Prism 8.0 后，在启动页选择：

New table & graph→XY→Options

进入参数配置界面后，请注意以下关键设置：

• X 轴类型：选择Numbers（数值型）
• Y 值输入方式：勾选Enter and plot a single Y value for each point

点击Create完成建表。

这个设置看似简单，实则至关重要。Cleveland 点图本质上是一种 XY 散点图的变体，每个点都有明确的 X 位置和 Y 数值。通过将 X 设为“数字”，我们确保了数据点能按序均匀排列；而“单个 Y 值”的设定则避免了重复测量或多变量模式干扰初始布局。

此时你会看到一个空白的数据表格，等待填入实验数据。

第二步：输入数据并定义语义标签

假设我们的研究涉及两种处理条件：对照组（CON）和模型组（MOD），共 8 个样本。X 轴编号为 1 到 8，前四属于 CON，后四属于 MOD。实际分组名称如下：

在数据表中输入对应的 X 和 Y 值：

接着，在左侧Row Titles列中依次填入df,dd,f,g,RT,ST,LT,MT。这些标题不会参与计算，但将在后续作为 X 轴的文本标签使用。

⚠️ 注意事项：Prism 按照 X 数值排序来定位数据点，因此必须保证 Row Title 的顺序与 X 值严格对应，否则会出现标签错位的问题。

第三步：初步图形生成与观察

完成数据输入后，Prism 会自动跳转到Graphs面板，显示默认的 XY 散点图。

此时你会看到一组孤立的圆点分布在坐标系中，没有边框、无网格线、也无分组标识。虽然数据已正确加载，但视觉传达效率很低——这正是我们需要进一步美化的起点。

第四步：图形美化与专业呈现

添加封闭式边框（Frame）

双击任意坐标轴，进入Format Axes设置窗口。

切换至Frame and Origin标签页：

• 在Frame区域选择Plain Frame
• 取消勾选 “Origin lines” 中的交叉线

应用后，绘图区域被一个干净的矩形包围，增强了整体的专业感。相比默认的开放轴线，这种设计更符合现代期刊图表的审美趋势。

💡 建议搭配浅灰色网格线使用，形成“轻量科技风”。

启用网格线以增强可读性

仍在Format Axes界面，切换至Frame and Grid Lines子面板：

• 将Major grid lines设置为Both X and Y axes
• 颜色设为Light Gray (#D3D3D3)
• 线条宽度设为1 pt

水平网格线尤其重要——它们帮助读者横向比对不同数据点的高度差异，是 Cleveland 图的核心辅助元素。

📌 实践建议：关闭 Y 轴主刻度线（Tick Marks），只保留网格线，减少视觉杂音，让焦点集中在数据本身。

替换 X 轴数字为语义标签

默认情况下，X 轴显示的是 1–8 的数值。我们需要将其替换为具有意义的分组名。

操作路径如下：

双击 X 轴 → 进入Format Axes→ 找到Regularly spaced ticks区域 →
将Number format设置为Row titles

确认后，X 轴上的数字立刻变为df,dd,f,g,RT,ST,LT,MT。

✅ 成功实现从“位置编码”到“信息表达”的转变，大幅提升图表的信息密度和可解释性。

区分 CON 与 MOD 组的样式

为了直观体现两组之间的差异，应对前四个点（CON）和后四个点（MOD）设置不同的颜色与形状。

操作方法：

双击任意数据点 → 弹出Format Graph窗口 →
在Data set options中识别两个子集：Dataset 1 (X=1-4)和Dataset 1 (X=5-8)

分别设置：

• CON 组（X=1–4）：蓝色填充 + 圆形符号
• MOD 组（X=5–8）：红色填充 + 方形符号

统一符号大小为6 pt，保持视觉平衡。

🧠 工程提示：若软件未自动拆分数据集，可在原始数据表中将两组 Y 值分列输入（即两列 Y），从而强制区分。

添加垂线（Spikes）强化数据落点感知

这是 Cleveland 点图的灵魂所在——通过从点到底轴的垂直连线，强调“数值—基线”的关系，形成类似“火柴棒”的视觉效果。

继续在Format Graph界面中找到：

Show bars/spikes/droplines→ 勾选Drop lines或Spikes

设置：
- 线条颜色：Match symbol color
- 宽度：1.5 pt

垂线直达 X 轴，不仅提升了美观度，也让读者更容易判断各点的相对高度。

微调坐标轴范围与添加标题

右键点击 Y 轴 →Format Axes→ 设置合理范围（如最小值 10，最大值 22），避免上下留白过多。

同时，在Title & Footnote中补充说明：

• Y 轴标题：“Physiological Index (AU)”
• X 轴标题：“Treatment Group”

适当的标注能让图表脱离上下文也能独立传达信息，这对投稿和会议展示尤为重要。

第五步：保存模板，提升长期效率

一张精心设计的图表不应只用一次。Prism 允许我们将当前图形保存为可复用的模板，极大提升未来工作的效率。

操作步骤：

File→Save Special→Save as Default Template或Save Example

之后新建图表时，可通过：

New table & graph→Clone a graph→ 加载已保存模板

一键还原所有格式设置，包括颜色、字体、网格线、边框等细节。

这对于实验室内部标准化图表风格、撰写系列论文或团队协作尤为实用。

导出高质量图像用于发表

当图表完成后，下一步就是导出适用于论文投稿的格式。

推荐设置如下：

导出路径：

File→Export→ 选择目标位置与参数 → 点击OK

💡 小技巧：如果需要插入 Word 或 PowerPoint，可以直接复制图形粘贴（Prism 支持矢量复制），或导出 PDF 格式嵌入文档，保证缩放不失真。

写在最后：为何值得投入时间掌握这一技能？

也许你会问：既然 R 可以一行代码画出类似的图，为什么还要花时间学 Prism？

这个问题的答案藏在“科研效率”的本质之中。

大多数研究人员的时间极其宝贵，他们需要的是快速、可靠、可重复的结果呈现方式。而 Prism 正是在这三个维度上表现出色：

• 快速：整个 Cleveland 点图构建过程不超过 10 分钟；
• 可靠：所有操作可视化，错误易发现、修改即时可见；
• 可重复：模板机制支持一键复现，适合批量处理相似数据。

此外，Prism 8.0 在图像输出质量上的飞跃（更高 DPI、更大尺寸、更好色彩管理），使其已成为许多顶级期刊推荐使用的绘图工具之一。

掌握这项技能，不只是学会画一张图，更是建立起一套高效、专业的科研可视化工作流。无论是写文章、做汇报，还是指导学生，这套方法都能带来实实在在的帮助。

如今，越来越多的科研评价不仅关注数据本身，也重视其表达质量。一张清晰、规范、富有设计感的图表，往往能让评审专家更快理解你的研究亮点。

而这一切，其实并不需要你会写代码。只要善用像 GraphPad Prism 这样的专业工具，每个人都能成为自己领域的“视觉叙事者”。