镁伽 Poreva Open 生物医药比赛共设5 道赛题
,分两轮发布:首轮 3 题(EGFR、TNF-α、GLP-1R,提交截止11 月 18 日)已在官网和媒体通稿中公布细节;次轮 2 题(KRAS G12D、BCL-2)目前仅公布题目方向,完整赛题说明将在11 月 8 日随轮次开启同步发布。
五道赛题一览
| # | 赛题 | 设计任务 | 提交截止 | 状态 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | EGFR(表皮生长因子受体) | 设计能识别人源及相关动物物种 EGFR、在酸性环境下实现选择性结合的蛋白质 | 2026-11-18 | ✅ 已公布 |
| 2 | TNF-α(肿瘤坏死因子-α) | 设计能结合人源及相关动物物种 TNF-α、根据环境 pH 变化实现结合与释放的蛋白质 | 2026-11-18 | ✅ 已公布 |
| 3 | GLP-1R(胰高血糖素样肽-1 受体) | 设计能结合人源 GLP-1R、并激活受体功能的蛋白质 | 2026-11-18 | ✅ 已公布 |
| 4 | KRAS G12D | 设计共价(covalent)KRAS G12D 结合剂 | 2026-12-08 | 🟡 题目已公布、细则 11-08 释出 |
| 5 | BCL-2 | 设计可切换(switchable)的 BCL-2 降解剂 | 2026-12-08 | 🟡 题目已公布、细则 11-08 释出 |
各靶点任务的技术含义拆解
挑战 1 — EGFR 的 pH 条件结合:据 EconoTimes 披露的赛题技术要求,具体指标为pH 6.5 可检测结合、pH 7.4 无可检测结合。这在实际应用中对应肿瘤微环境靶向递送——肿瘤组织微环境偏酸,酸性条件选择性结合意味着分子进入肿瘤区域才"抓住"靶点,在正常组织(pH≈7.4)中不结合,可降低脱靶毒性。
挑战 2 — TNF-α 的 pH 响应开关:与挑战 1 方向相反,技术要求为pH 7.4 结合、pH 6.0 无可检测结合。这是"酸释放"逻辑——TNF-α 是自身免疫病(类风湿等)的核心炎症因子,中和性结合剂在血液循环(pH 7.4)中封闭 TNF-α,但进入酸性炎症病灶或内吞体后解离释放,避免组织内长期中和造成的免疫抑制副作用。
挑战 3 — GLP-1R 的受体激活:这是五个题目中唯一明确要求功能活性而非单纯结合的——须在细胞实验中证明能激活 GLP-1R。GLP-1R 是糖尿病/减重药物(司美格鲁肽类)的核心靶点,设计兼具结合与信号转导能力的全新蛋白,难度显著高于 minibinder。
挑战 4 — KRAS G12D 共价结合剂:KRAS 长期被称为"不可成药"靶点,G12D 是胰腺癌、结直肠癌高频突变。共价结合意味着设计蛋白需携带能与突变半胱氨酸(G12D 突变引入的口袋)形成共价键的残基,属于从结合设计升级到化学选择性设计。
挑战 5 — BCL-2 可切换降解剂:BCL-2 是抗凋亡蛋白(血液肿瘤经典靶点),"switchable degrader"暗示需设计可条件性诱导 BCL-2 降解的蛋白分子,可能涉及结合后触发降解通路(如溶酶体途径),属较前沿的降解设计方向。
关键时间节点(官网最新版)
| 阶段 | 时间 |
|---|---|
| 首轮报名 + 提交(挑战 1—3) | 10-18 至11-18 |
| 首轮序列筛选 | 11-19 至 11-25 |
| 首轮入选名单公布 | 11-26 |
| 次轮发布 + 提交(挑战 4—5) | 11-08至 12-08 |
| 次轮序列筛选 | 12-09 至 12-15 |
| 次轮入选名单公布 | 12-16 |
| 统一湿实验验证 | 2026-12 至 2027-03 |
| 验证结果公布 | 2027 年 3 月下旬 |
提交与验证规则要点
- 需提交可复现元数据:除序列外,须附模型版本、随机种子、结构模板等说明,截止后提交包封存不可修改;
- 统一双盲实验流程:所有入选序列在镁伽鲲鹏实验室(苏州)同一套流程下完成表达、纯化、结合检测,设计身份与实验执行分离;
- 验证维度:表达量、亲和力/动力学、特异性(脱靶/交叉反应)、细胞功能、理化性质、可开发性六维,超出常规比赛的"只看亲和力";
- 赛题与 Anthropic×Adaptyv 前三题对应:镁伽官方说明首轮 3 题选择了与 Anthropic 挑战赛相对应的靶点,方便直接对比 Claude 等模型与人类团队在相同靶点上的表现。
一点提醒
关于赛题 4/5(KRAS G12D、BCL-2),目前官网只给出题目方向(“covalent binder” “switchable degrader”),完整的技术要求、评价细则、提交规则要等 11 月 8 日才能看到。若打算做这两题,建议 11 月 8 日第一时间打开官网抓取细则,因为次轮窗口仅 30 天(11-08 至 12-08),比首轮的 31 天稍紧。
而赛题 1—3 的提交截止 11 月 18 日距今约 22 天,是当前唯一立即可以动手的三道题,工具链仍是标准套件:RFdiffusion 生成骨架 + ProteinMPNN/LigandMPNN 设计序列 + AlphaFold3 复核,pH 选择性需在序列设计时引入组氨酸富集(His 咪唑基 pKa≈6.0,是天然的 pH 开关元件)等策略。